Инициация пептидной цепи (часть 2)
Отдельные этапы этого процесса показаны схематически на рисунке 6.3. Несмотря на то что функциональные особенности всех белковых факторов, необходимых для образования 80S инициаторного комплекса у высших растений, полностью не изучены, их можно сопоставить с другими, более детально исследованными системами эукариот.
Образование нативных субъединиц рибосомы. мРНК может связываться только рибосомами, диссоциированными на субъединицы, поэтому 80S рибосомы, образуемые во время терминации цепи, временно диссоциируют на свободные субъединицы, как только освобождаются от мРНК. Условия in vivo способствуют неферментативной реассоциации в нефункциональные 80S мономеры, однако такому объединению в клетке субъединиц препятствует белок, который действует как антиассоциагивный фактор и у эукариот называется фактором инициации 3 (эФИ-3). Этот фактор связывается с малой рибосомальной субъединицей, независимо от снабжения энергией или других факторов, и препятствует присоединению большой субъединицы [рис. 6.3, этап (1)]. Фактор, обладающий свойствами эФИ-3, обнаружен в зародыше пшеницы, где большой эФИ-3 комплекс содержит 9—11 субъединиц с молекулярной массой от 35000 до 160000. Кроме того, зародыш пшеницы содержит антиассоциативный фактор эФИ-6, который, по-видимому, присоединяется к 60S субъединице рибосомы и препятствует ее реассоциации с малой субъединицей. По всей видимости, оба эти фактора, эФИ-3 и эФИ-6, скорее препятствуют реассоциации субъединиц, чем активно диссоциируют 80S рибосомы, однако во многих клетках эукариот содержится заметное количество 80S рибосом, которые не могут принять участие в синтезе белка, пока не будут диссоциированы на субъединицы. Такая диссоциация, по-видимому, протекает в клетке значительно медленнее, чем круговорот субъединиц между связанным в полисомы и свободным состоянием.
Связывание Мет-тРНКф с нативными 40S субъектами. Этот двустадийный процесс включает сначала образование трехкомпонентного комплекса эФИ-2. ГТФ, Мет-тРНКф, а затем связывание этого комплекса с нативной 40S субъединицей [комплекс 405. эФИ-3, рис. 6.3, этап (2)]. Выделенный из зародышей пшеницы фактор эФИ-2 состоит из трех полипептидов с молекулярной массой 56000, 41000 и 36000 в стехиометрическом соотношении 1:1:1. Образование трех компонентного комплекса происходит в строгой очередности: ГТФ связывается перед присоединением Мет-тРНКф.
