Молекулы тРНК (часть 1)
К настоящему времени определены последовательности оснований в более чем 70 молекулах тРНК из нескольких видов растений, результаты этих исследований позволяют выделить черты, общие для всех тРНК. Молекула тРНК — это одинарная полинуклеотидам цепь, содержащая от 73 до 93 рибонуклеотидов, среди которых много редких, или минорных, оснований, примеры которых приведены в таблице 5.7; как правило, на одну молекулу тРНК приходится от 7 до 15 таких модифицированных оснований.
Можно видеть, что многие из них — метилированные производные обычных оснований, которые образуются путем ферментативной модификации молекулы тРНК-предшественника. Такое метилирование основании может ограничивать образование некоторых пар оснований в молекуле, это способствует специфическому спариванию неметилированных оснований и повышению гидрофобности некоторых участков молекулы тРНК, что может иметь важное значение при взаимодействии молекул тРНК с ферментами-синтетазами и рибосомальными белками.
Все известные последовательности тРНК можно представить в виде структуры, напоминающей по форме лист клевера (рис. 5.13), в которой около 50% остатков составляют спаренные основания; 5'-конец молекулы тРНК фосфорилирован, и 5'-концевым остатком обычно является фГ. Последовательность оснований с 3'-конца — обычно ЦЦА, причем эти три основания не участвуют в образовании водородных связей и 3'-OH-группа концевого остатка аденозина служит точкой связывания тРНК с активированной аминокислотой в процессе синтеза белка. Помимо неспаренных оснований на 3'-ЦЦА-конце, не спарены еще четыре группы оснований, образующие участки выпяченных петель в структуре клеверного листа - петля TФЛ, петля ДГУ, петля антикодона и дополнительная петля с переменным числом остатков (рис. 5.13).
Антикодоновая петля, по всей видимости, включает семь оснований, расположенных в следующей последовательности:
